Lieferung, Aufstellung, Inbetriebnahme, Aufstellungsprüfung und Einweisung eines UHPLC-MS System (Q Exactive HF-X)

Zur Anschaffung steht ein FT-Massenspektrometer (FT-MS), das mit einer „Ultra-high Pressure Liquid Chromatograph“ (UHPLC)-Kopplung versehen werden soll. Das Gerät ersetzt ein Massenspektrometer (LTQ Orbitrap XL, Anschaffungsjahr 2008). Das Gerät ist sowohl für eigene Forschungsprojekte des Proteom Centrums Tübingen (PCT), als auch für eine zentrale Nutzung im Rahmen der Proteomics Core Facility vorgesehen. Das beantragte Gerät wird für die Weiterentwicklung der Methoden im Bereich Quantitative MS verwendet und in einer Vielzahl von laufenden Kooperationen eingesetzt. Das Gerät wird in groß angelegten „Shotgun“-Proteomics Projekten eingesetzt, in denen sehr komplexe Peptidgemische mit Stabilisotopen (z. B. SILAC oder 11-plex TMT Tags) markiert und analysiert werden. Daher muss das Gerät eine hohe Sensitivität (150 fg Reserpine S/N>150), Sequenzierungsgeschwindigkeit (MS/MS 40 Hz), Massenauflösung (240,000 bei 200 m/z) und Genauigkeit der ermittelten Massenspektren (<1ppm bei interner Kalibrierung) erreichen. Wegen des Einsatzes in der Core Facility müssen Standardabläufe eingehalten werden. Daher muss das Gerät mit den vorhandenen Arbeitsabläufen (Probenvorbereitung und Datenanalyse), sowie Geräten (Easy nLC 1200 UHPLC, LTQ Orbitrap Elite, Q Exactive HF) völlig kompatibel sein. Alle Quantifizierungsmodi (SILAC, TMT, label-free) müssen von der MaxQuant Software unterstützt werden. Wegen des begrenzten Laborplatzes im MS-Raum 1.049 (VG, AdM 15, Tübingen), muss es sich um ein Benchtop-Gerät handeln, dessen Außenabmessungen 1 000 mm x 1 000 mm x 1 000 mm (BxHxT) nicht überschreiten. Aufgrund dieser zwingenden Anforderung in Verbindung mit technischen Patenten, kann ausschließlich das hier beschriebene Gerät zum Einsatz kommen.