Beschaffung Benchtop-Sequenzierungssystem (2024029)

Das NextSeq2000 Next-Generation-Sequenzierungssystem ist eine vielseitige Benchtop-Sequenzierungsplattform der neuesten Generation für eine Vielzahl von Anwendungen, darunter Genom- und Exomsequenzierung, gezielte Amplikonsequenzierung oder Sequenzierung genomweiter CRISPR-Screens, metagenomische und 16S-Mikrobiomsequenzierung, ChIP-Sequenzierung und Sequenzierung für Einzelzellenanwendungen und deckt somit das komplette Spektrum von möglichen Anwendungsbereichen ab. Die Illumina NextSeq 2000-Plattform bietet die höchste Clusterdichte aller verfügbaren NGS-Tischsequenzierer aller Anbieter auf dem Markt, was die Kosten pro Probe und pro Basenpaar drastisch senkt. Darüber hinaus können aus verschiedenen Reagenzien/Sequenzierkartuschen mit einer Kapazität bis zu 360 GB pro Kartusche individuell die passenden gewählt werden, um die Menge an Sequenzierungsreagenzien den jeweiligen Experimenten anzupassen, was ebenfalls die Kosten senkt. Durch eine Vielzahl verschiedener verfügbarer Library Preparations-Kits, angepasst an die Sequenzierplattform, kann die Bibliotheksvorbereitung routinemäßig in den verschiedenen Laboren am Standort standardisiert durchgeführt werden. Darüber hinaus haben wir in unseren Laboren unsere Primer und Library-Vorbereitung für funktionelle CRISPR-Screens für den Einsatz mit der Illumina NextSeq 2000-Chemie optimiert. Im Gegensatz zu anderen Sequenzierungsgeräten ist der NextSeq 2000 das ideale Instrument, das kleinere und größere Sequenzierungsanwendungen, Kosteneffizienz und Benutzerfreundlichkeit vereint. Die integrierte, cloudbasierte Datenanalyseplattform innerhalb des Instruments automatisiert sekundäre Analysepipelines für die Ausgabe verschiedener Standarddateiformate, aber auch automatisierter Varianten- oder In-Del-Aufrufalgorithmen. Es sind keine vergleichbaren Tischsequenzer anderer Anbieter auf dem Markt erhältlich, die diese Eigenschaften vereinen. Zusammenfassend handelt es sich bei dem vorgeschlagenen Instrument um einen äußerst flexiblen und vielseitigen Sequenzierer, der alle Anforderungen der modernen (funktionellen) Genomforschung abdeckt.