hochauflösende Flüssigchromatographie - Hybrid Massenspektrometrie Systeme

Das Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften -ISAS e.V.- plant die Beschaffung von hochauflösenden Flüssigchromatographie - Hybrid Massenspektrometrie Systemen (LC-MS/MS), um klinische Proben mit sehr hoher molekularer Abdeckung und bester Sensitivität analysieren zu können. Dies ist insbesondere bei sehr geringen Probenmengen erforderlich, wenn es sich z.B. um Biopsien des Herzens, isolierte einzelne Immunzellen nach steriler Inflammation oder Mikrometastasen handelt. Gleichzeitig soll die Translation der Messverfahren in präklinische Anwendungen beschleunigt werden. Daher ist eine Kombination von zwei Systemen geplant, die sich technisch ergänzen und sowohl die Identifikation von Biomarker Kandidaten "Discovery Plattform" als auch die Validierung von Biomarker Kandidaten "Validation Plattform" ermöglichen. Bei den geplanten Probenmaterialien handelt es sich um Blut (Blutplasma, Blutzellen) und Gewebeproben von Patienten. Dies sind z.B.: Biopsien des Herzens, isolierte einzelne Immunzellen nach steriler Inflammation oder Mikrometastasen aus verschiedenen Geweben. Um diese Proben bestmöglich analysieren zu können, ist eine Instrumentenplattform erforderlich, die möglichst viele Analyten in kurzer Zeit strukturell untersuchen kann und gleichzeitig eine sehr gute Sensitivität besitzt. Durch die zu verwendende Gerätekombination sollen auch moderne Methoden wie die "Daten unabhängige Datenaquisition" (DIA) zum Einsatz kommen. Gleichzeitig liegt ein Fokus auf der Entwicklung quantitativer Assays um die gewonnenen Erkenntnisse direkt in geeigneten Patientenkohorten zu validieren. Auf Basis der Erfahrungen am ISAS liegt die Größe solcher Kohorten im Bereich 100-400 Patienten, in denen - je nach Fragestellung - ca. 1000 - 8000 Peptide detektiert werden müssen, um die Ergebnisse zu validieren.