# Sequenzierung von Metagenom und Metatranskriptom in Extrakten aus Sedimentproben und Mikrokosmos-Studien

Abgelaufen

Bundesanstalt für Gewässerkunde hat einen Auftrag für Forschung und Studien in Koblenz ausgeschrieben. Die Angebotsfrist endete am 12.10.2023. Bisher kein Ergebnis gefunden.

- Auftraggeber: [Bundesanstalt für Gewässerkunde](https://vergabeweiser.de/vergabestelle/bundesanstalt-fuer-gewaesserkunde)
- Was: Forschung und Studien: Sequenzierung von Metagenom und Metatranskriptom in Extrakten aus Sedimentproben und Mikrokosmos-Studien
- Wo: Koblenz, Rheinland-Pfalz
- Bis wann: Angebotsfrist 12.10.2023, 10:00 Uhr
- Wer kann anbieten: Jedes Unternehmen, das die Anforderungen der Vergabeunterlagen erfüllt.
- Vergabeunterlagen: https://www.evergabe-online.de/tenderdetails.html?id=538540
- Vergabeplattform: [evergabe-online.de](https://vergabeweiser.de/plattform/evergabe-online)

## Leistungsumfang

Gegenstand der Ausschreibung ist die Durchführung von Metagenom- sowie Metatranskriptomsequenzierungen zur taxonomischen wie funktionellen Charakterisierung prokaryotischer Lebensgemeinschaften aus Umwelt- und Mikrokosmosprobe. Die Analysen müssen zur Erreichung der notwendigen Sequenziertiefe mittels Hochdurchsatzsequenzierung unter Verwendung der Illumina Sequenziertechnologie erfolgen. Die Leistung ist dabei in folgende zwei Arbeitspakete unterteilt: Arbeitspaket 1 - Metagenomsequenzierung von total DNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben - Qualitätskontrolle der durch den Auftraggeber (AG) gelieferten DNA-Proben - DNA Fragmentierung der durch den AG gelieferten DNA-Extrakte (total DNA) von insgesamt maximal 160 Proben - Erstellung der Whole-Genome-Sequencing Library aus den Proben - Aufreinigung, Normalisierung und QC der WGS-Library - Anwendung der Methode des bidirektionalen „paired-end sequencing“ (PE) mit 2 x 150 bp und >=50 Mio Reads pro Sample - Bei den gelieferten Daten müssen mindestens 75% der Basen die Qualität Q30 oder besser besitzen. - Die Sequenzrohdaten müssen vom AN in einem vom AG weiterbearbeitbaren Format (FASTQ-Format) geliefert werden und gemäß ihrer Probenzugehörigkeit sortiert sein. - Lieferung der Ergebnisse: maximal 30 Arbeitstage nach Erhalt der Proben Arbeitspaket 2 - Metatranskriptomsequenzierung von total RNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben - Qualitätskontrolle der durch den AG gelieferten Proben - Entfernung von rRNA aus den durch den AG gelieferten RNA-Extrakten (total RNA) von insgesamt maximal 80 Proben - RNA Fragmentierung - cDNA Reverse Transkription der RNA Fragmente - Erstellung der Sequencing Library aus den Proben - Aufreinigung, Normalisierung und QC der Library - Anwendung der Methode des bidirektionalen „paired-end sequencing“ (PE) mit 2 x 150 bp und >=50 Mio Reads pro Sample - Bei den gelieferten Daten müssen mindestens 75% der Basen die Qualität Q30 oder besser besitzen. - Die Sequenzrohdaten müssen vom AN in einem vom AG weiterbearbeitbaren Format (z.B. FASTQ-Format) geliefert werden und gemäß ihrer Probenzugehörigkeit sortiert sein - Lieferung der Ergebnisse: maximal 30 Arbeitstage nach Erhalt der Proben Die vollständige Beschreibung der zu erbingenden Leistungen entnehmen Sie bitte den Vergabeunterlagen

## Angaben laut Bekanntmachung

- Verfahren: Öffentliche Ausschreibung (national)
- Art des Auftrags: nicht angegeben
- Geschätzter Wert: nicht angegeben
- Bindefrist: 60 Tage nach Angebotsfrist
- CPV-Code: 73111000-3
- CPV-Bezeichnung: Forschungslabordienste
- Bekanntmachungs-ID: 2d349966-6654-4fba-8a28-33830813f99e

## Verlauf

- 21.09.2023: Ausschreibung veröffentlicht
- 20.11.2023: Bekanntmachung geändert · Das Vergabeverfahren wurde eingestellt

## Zuschläge dieses Auftraggebers

- [HYDPY OH-MEW - HydPy Obere Havel mit Müritz-Elde-Wasserstraße Wasserhaushalts- und Bewirtschaftungsmodellierung, 1D-hydraulische Modellierung & Szenarienrechnungen](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/hydpy-oh-mew-hydpy-obere-havel-mit-mueritz-elde-wasserstrasse-ae3e7404) · Zuschlag 01.07.2026 an Björnsen Beratende Ingenieure GmbH · 2 Angebote
- [Erstellung von hydrodynamisch-numerischen Modellen der Lahn (LOS 1), der Mosel (LOS 2) und der Saar (LOS 3)](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/erstellung-von-hydrodynamisch-numerischen-modellen-der-lahn-los-1-der-37e140fe) · Zuschlag 26.05.2026 an Hydrotec Ingenieurgesellschaft für Wasser und Umwelt mbH und sje - Ecohydraulic Engineering GmbH · 2–3 Angebote je Los
- [Erstellen ökologisch orientierter Unterhaltungspläne für die Bundeswasserstraßen Aller & Leine im Zuständigkeitsbereich des Außenbezirks Oldau (Los A) sowie für die Bundeswasserstraßen Este, Lühe und Schwinge im Zuständigkeitsbereich des Außenbezirks Stade (Los B)](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/erstellen-oekologisch-orientierter-unterhaltungsplaene-fuer-die-eb9cb9b9) · Zuschlag 16.03.2026 an Einzelunternehmen aus Hilden · 1 Angebote je Los
- [Servicevertrages zur Unterstützung der Dateninfrastruktur des Berichtsportals Wasser](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/servicevertrages-zur-unterstuetzung-der-dateninfrastruktur-des-2b37e8fb) · Zuschlag 04.02.2026 an interactive instruments Gesellschaft für Software-Entwicklung mbH · 1 Angebot
- [HydPy Support 2026-2029](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/hydpy-support-2026-2029-c7bf7e41) · Zuschlag 26.01.2026 an Björnsen Beratende Ingenieure GmbH · 1 Angebot
- [Ersatzbeschaffung Flüssigszintillationsmessgerät (LSC)](https://vergabeweiser.de/ausschreibung/ersatzbeschaffung-fluessigszintillationsmessgeraet-lsc-7484822a) · Zuschlag 17.12.2025 an Hidex Deutschland Vertrieb GmbH

## Von hier aus weiter

- [Öffentliche Ausschreibungen in Koblenz](https://vergabeweiser.de/region/rheinland-pfalz/koblenz): Offene Ausschreibungen aller Branchen
- [Bundesanstalt für Gewässerkunde](https://vergabeweiser.de/vergabestelle/bundesanstalt-fuer-gewaesserkunde): Ausschreibungen und Zuschläge dieser Vergabestelle
- [Ausschreibungen des Bundes](https://vergabeweiser.de/thema/bund): Ausschreibungen und Zahlen
- [Öffentliche Ausschreibung](https://vergabeweiser.de/wissen/oeffentliche-ausschreibung): Wissen: Ablauf und Begriffe

Automatisch aus den Feldern der Bekanntmachung vom 20.11.2023, ohne KI. Die Branche ordnen wir selbst zu. Stand: 01.11.2026.

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Quelle: Bekanntmachung auf oeffentlichevergabe.de (CC0), https://oeffentlichevergabe.de/ui/de/search/details?noticeId=2d349966-6654-4fba-8a28-33830813f99e. Maßgeblich ist die Bekanntmachung. Seite: https://vergabeweiser.de/ausschreibung/sequenzierung-von-metagenom-und-metatranskriptom-in-extrakten-aus-2d349966